Az afsR szerepének vizsgálata a Streptomyces griseus antibiotikum termelésének és differenciálódásának szabályozásában

Nyomtatóbarát változatNyomtatóbarát változat
Konferencia: 
2015/2016. tanév
Tagozat: 
Kísérletes immunológia, mikrobiológia
Előadó szerző adatai
Név (format for foreign students: Last Name, First Name): 
Márton Éva

Előadás adatai

Előadás címe: 
Az afsR szerepének vizsgálata a Streptomyces griseus antibiotikum termelésének és differenciálódásának szabályozásában
Összefoglaló: 

.Az antbiotikumok széleskörű egészségügyi felhasználásával párhuzamosan elkezdődött a rezisztens kórokozók kiszelektálódása és gyors terjedése, mely egy „poszt-antibiotikumos” kor eljövetelével fenyeget és új típusú antibiotikumok felfedezését sürgeti. A Streptomyces baktériumok széleskörű szekunder metabolit termelő képességük miatt kerültek az antibiotikum kutatás középpontjába. Antibiotikum termelésük elindításában kulcsfontosságúak az extracelluláris autoregulátor molekulák, mint pl. a S. griseus által termelt A-faktor. Korábbi vizsgálatok kimutatták, hogy az A-faktor termelésére nem képes S. griseus B2682-AFN törzs egy nonszensz mutációval rendelkezik az afsR génben, amely ezen protein kináz útvonal A-faktor termelés szabályozásában betöltött szerepét feltételezi. Azt bizonyítandó, hogy valóban az afsR mutációval magyarázható az AFN törzs A-faktor defektusa, célul tűztük ki ezen törzs, egy funkcióképes afsR változattal való transzformálását. Ennek érdekében a S. griseus vad típusú törzséből izolált DNS templátként való felhasználásával az afsR gént PCR-rel amplifikáltuk. A klónozáshoz az alacsony kópiaszámú pHJL401 és a magas kópiaszámú pWHM3 Streptomycesekben és Escherichia coliban is fenntartható ingázó plazmidokat választottuk. A PCR terméket XbaI és EcoRI restrikciós enzimekkel való hasítását követően az ugyanezen enzimekkel megvágott plazmidokba ligáltuk. Mivel a Streptomycesek kifejezetten rossz transzformációs hatékonysággal rendelkeznek, a ligátumokat az E. coli TOP10 törzsébe transzformáltuk a hősokk módszert követve. A pHJL401-afsR és pWHM3-afsR plazmidokat felvett transzformánsokat ampicillint tartalmazó LB táptalajon szelektáltuk. A klónokból a plazmidokat alkalikus lízissel visszaizoláltuk, majd a későbbi Streptomyces transzformálás hatékonyágát növelendő az E. coli ET12567 törzsbe transzformáltuk. Az ezen törzsből visszaizolált plazmidokat használtuk fel a S. griseus AFN törzsének transzformálásához, melyet protoplasztálást követően PEG1000 jelenlétében végeztük. A továbbiakban céljaink között szerepel a thiostrepton rezisztencia segítségével szelektált transzformánsok ellenőrzése és fenotípusos jellemzése.

1. témavezető adatai
Név: 
Dr. Szilágyi-Bónizs Melinda
Intézet / Tanszék/ Klinika: 
Humángenetikai Tanszék

Támogatók: Támogatók: Az NTP-TDK-14-0007 számú, A Debreceni Egyetem ÁOK TDK tevékenység népszerűsítése helyi konferencia keretében, az NTP-TDK-14-0006 számú, A Debreceni Egyetem Népegészségügyi Karán folyó Tudományos Diákköri kutatások támogatása, NTP-HHTDK-15-0011-es A Debreceni Egyetem ÁOK TDK tevékenység népszerűsítése 2016. évi helyi konferencia keretében, valamint a NTP-HHTDK-15-0057-es számú, A Debreceni Egyetem Népegészségügyi Karán folyó Tudományos Diákköri kutatások támogatása című pályázatokhoz kapcsolódóan az Emberi Erőforrás Támogatáskezelő, az Emberi Erőforrások Minisztériuma, az Oktatáskutató és Fejlesztő Intézet és a Nemzeti Tehetség Program